Le Bureau de la Fédération Européenne des Académies de Médecine (FEAM) est composé de cinq membres honoraires élus parmi les membres des Délégations et par l'Assemblée générale:

Président (2012- 2013):	Professeur Laurentiu Popescu (Roumanie)
Vice-président(2012-2013):	Professor Dermot Kelleher (Irlande)
Secrétaire général (2012-2015):	Professor Paul-Pierre Pastoret (Belgique)
Trésorier (2009-2012):	Professeur Francisco Rubia Vila (Espagne)
Il y a quatre Membres supplémentaires, avec voix consultative:
Past président:	Professeur Hubert E. Blum (Allemagne)
Secrétaire général adjoint:	Professeur Paolo Villari (Italie)
Conseiller scientifique:	Professeur Sir Peter Lachmann (Royaume Uni)
Conseiller scientifique:	Professeur Charles Pilet (France)
Conseiller scientifique:	Professor Luigi Frati (Italie)
Conseiller scientifique:	Professor Cyril Höschl (République tchèque)

Le Bureau représente la Fédération et veille à son bon fonctionnement. Les réunions du Bureau se tiennent semestriellement.

L'Assemblée générale est l'organe souverain de la Fédération. Ses compétences incluent l'approbation des budgets et des comptes, l'élection et la révocation des membres du Bureau, la modification et la dissolution de l'association. La Fédération se réunit au moins une fois par an en assemblée générale et l'ordre du jour est fixé par le Secrétaire Général en accord avec le Président.